Els microscopis estèreo es poden classificar de moltes maneres segons diferents estàndards. A continuació, es mostren classificacions detallades i les seves característiques:
Classificació per ampliació:
Microscopis estèreo de baixa potència: la ampliació és entre 7x -45 x, adequada per a soldadura electrònica de productes, inspecció de la placa de circuit, etc.
Microscopis estèreo de potència mitjana: la ampliació és entre 20x -100 x, adequada per a la dissecció biològica, observació de les exemplars, etc.
Microscopis estèreo d’alta potència: la ampliació és per sobre de 100x, adequada per a la inspecció de peces de precisió, anàlisi de materials, etc.
Classificació per sistema de ruta òptica:
Sistema de ruta òptica de Greenough: la imatge és tridimensional i té una alta resolució, adequada per a ocasions amb requisits d’alta qualitat d’imatge, com la identificació de joieria, la restauració d’antiguitats, etc.
Sistema de ruta òptica de CMO: l'estructura és senzilla i el cost és baix, adequat per a l'observació i inspecció rutinària, com la inspecció electrònica de components, la inspecció de qualitat del producte imprès, etc.
Sistema òptic galileà: té un ampli camp de vista i una gran profunditat de camp, i és adequat per a situacions en què cal observar mostres més grans, com ara la inspecció del tauler de PCB, la inspecció tèxtil, etc. Mostres opaces, com ara parts metàl·liques, exemplars minerals, etc. Il·luminació anular: proporciona efectes d’il·luminació uniformes i redueix les ombres, i és adequada per a la inspecció de peces de precisió, inspecció de defectes superficials, etc. Classificació mitjançant ús: microscopi estereo industrial: s’utilitza principalment per a la producció i inspecció industrial, com ara fabricació electrònica, mecanitzat, etc. Investigació i ensenyament, com experiments anatòmics, observació de les exemplars, etc. Identificació de GEM Microscopi estèreo: s’utilitza principalment per a la identificació i avaluació de GEM, com ara la classificació de diamants, la identificació de Jade, etc.
